奇穴的应用,主要有两个方面:一是用于治疗所在部位的病变,如气喘治哮喘、腰眼治腰痛等;其次是治疗远隔部位的疾患,如大小骨空治目疾、二白治痔疮等。奇穴的作用,同样是通过经络的传导,以调整经气的异常变化。奇穴虽然没有列入十四经输穴系统,但其所在的部位并没有离开经络分布的领域。